儿童切除扁桃体后一般不会有明显后遗症，极少数有可能出现发音异常、食物反流的后遗症。

扁桃体又称为腭扁桃体，扁桃体有一对，位于我们口咽部的入口处，呈卵圆形，表面凹凸不平，通常张口后即可看见。正常的扁桃体组织位于我们的扁桃体窝内，表面呈淡红色。扁桃体是主管我们机体的免疫功能。扁桃体肥大常见于儿童和青少年，随着年龄的增长，儿童扁桃体免疫功能逐渐活跃，特别是3～5岁时因接触外界变应原的机会增多，扁桃体显著增大，此时的扁桃体肥大应视为正常生理现象。但扁桃体过度肥大，将会导致患儿呼吸道梗阻，严重者甚至出现低氧血症，当过度肥大的扁桃体引起了临床症状，影响患者的生活质量时，是可以通过手术切除的方式来改善症状的。

扁桃体作为局部免疫器官，具有重要的生理功能。特别是儿童，咽部淋巴组织具有明显的保护作用。任意切除这些组织将削弱局部组织器官的抗病能力，甚至降低呼吸道局部免疫力，出现免疫监视障碍。故应正确认识扁桃体的生理功能，严格掌握手术适应证。4岁以下儿童，如无特殊情况不施行扁桃体切除术。总之，既应反对不论有无适应证，一概加以切除的“手术无害论”，也要反对对慢性发炎的扁桃体采取姑息的态度。对病灶性扁桃体，要结合具体情况加强术前及术后的应对措施。